Najczęstszą, a jednak często niezdiagnozowaną, przyczyną nadmiaru śluzu jest refluks żołądkowy. Występuje on, gdy zastawka w górnej części żołądka nie zamyka się prawidłowo, co umożliwia cofanie się kwasu żołądkowego do przełyku i gardła. Chociaż kwas ten jest niezbędny do trawienia, uszkadza tkanki, gdy dociera do obszarów takich jak gardło czy zatoki, powodując stan zapalny. Aby się bronić, organizm produkuje śluz, który chroni te uszkodzone obszary. Refluksowi może towarzyszyć zgaga, ale w wielu przypadkach pojawiają się jedynie objawy związane ze śluzem – stan ten nazywany jest cichym refluksem lub chorobą refluksową przełyku (GERD).